第四，德卡本特答应，在其势力范围内保证明国商人生命财产的安全，并在海上尽可能保护明国商人，给予其与荷兰商人相同的权力。大明也将保证荷兰商人在明国海域内的生命财产安全，并对荷兰商人的正当要求予以帮助。
第五，为了增进双方的信任与了解，德卡本特认可大明提出的裁判权的合理要求，但此仅限于南洋地区，且针对除荷兰人以外的第三方。如果明人与荷兰人发生冲突时，将由荷兰秉着公平、公正的原则处理，并将结果会知明国官员。
第六，大明放弃对荷兰的赔款要求。但为了增进荷兰与大明的友谊，荷兰国将传授相应的造船技巧，帮助大明在厦门建立一座最先进的大型船厂，主要用作建造商船之用。并且，荷兰会帮助大明招募一批合格的荷兰造船技师，供船厂建造完毕后使用。
谈判的结果，双方都很满意，在鞭炮声中，董宣武和德卡本特各自代表大明和荷兰，在和议书上签署下自己的名字。
这份和议书，在当时来看，只双方相互保障彼此利益的一小步，但从更长远的时间来看，却是大明重新迈向海洋强国的一大步。
在董宣武与荷兰谈判期间，经过朝廷多番讨论，董宣武提出的建立大明南洋水师的建议，朝廷终于批准了。并且朝廷拨出了两白万两银子，任命董宣武为南洋水师总督，全权负责南洋水师筹办事宜，统一管理原浙江、福建、广州水师。
这个建议之所以能够批准，一方面是因为大明复兴会的坚持，另一方面，也是因为魏党、东林党的群臣目光狭隘，思维仍然停留在陆地上，没有看到海洋广阔前景。只注意陆军，并不将水师太放在心上。
至于贵州改土归流事宜，鉴于其已经基本走上正轨，董宣武又在台湾，负责大明南洋水师事宜，难以兼顾，所以转交由熊廷弼负责。
熊廷弼被任命为贵州巡抚，即日前往贵州赴任。同时免去董宣武贵州总督之职。
魏党和东林党人希望通过这种方式，削弱董宣武对贵州的控制力，打击新建立的大明复兴会。
之所以选择熊廷弼而不是他人，一来，是因为熊廷弼有资历和经验，的确有才能，既有处理改土推流复杂事务的能力，同时也有统帅大军的军事本事；二来，也是因为调走了熊廷弼，魏党和东林党人可以进一步控制京畿的那五营五行卫。
同时，由熊廷弼来接手贵州事宜，也能避免与董宣武直接发生冲突。董宣武与熊廷弼的私交颇好，且同为大明复兴会的人，这样的安排，董宣武理应会接受。
是魏党和东林党的意思，同时也是天启皇帝的意思。
说到底，对于董宣武，朝廷始终都是既用着，也防着。
为了安抚董宣武，朝廷封董宣武为少保，那可是位极人臣的从一品大臣，虽然是虚衔，但也不知是多少人梦寐以求的荣耀。
累计董宣武的功勋，文散官升任正五品奉议大夫，武散官升任正二品骠骑将军，文勋议了个从四品赞治少尹，武勋议了个正二品上护军。
除此之外，天启皇帝兑现了承诺，不顾群臣的反对，赐予董宣武同进士出身。虽然董宣武并不在乎，但意义却非同小可。
从此以后，董宣武没有参加科举，却也可堂堂正正位列文臣班列，这也是大明立国以来从未有过的事。
董宣武猜想，天启皇帝想要通过这种方式，让他不要怨怼，只要他忠于大明，死心塌地为大明做事，日后出将入相，进入内阁，也未必是不可能的事。
当然，董宣武依然是五行卫指挥使，统领着五行卫，这一块，谁都不敢动。毕竟，五行卫全靠五行商团养着，五行商团虽有五行之名，但其实早就与五行卫分离开来，是独立的一块。而五行卫养军的钱财完全是五行商团以捐赠为名提供。
这是董宣武的保全手段，他深知，在这个时代，军权的重要性。而控制一支军队，最重要的是控制它的经济来源。
黔军也有类似的机制，黔军养军的主要资金也是来自五行商团，同样以捐赠为名提供。只是这件事，除了天启皇帝、信王两人，魏党和东林党人并不知内情。他们以为，利用熊廷弼、熊兆琏父子两人，就能让贵州脱离董宣武的掌控。
须不知熊兆琏早就倒向了董宣武，熊廷弼虽然是帝党，但只要董宣武不造反，他同样不会拆董宣武的后台。贵州依然牢牢掌握在董宣武手中。
天启皇帝虽然知道内情，但是自从三子献怀太子朱慈炅在王恭厂大爆炸中意外夭折后，他已经心灰意冷，已经不太管朝政。更多的时间，都默默地做他的木匠。为董宣武争取同进士出身，是他最近唯一一次出手。
经过这么一段时间的经营，贵州发展迅速，经济迅速繁荣起来，特别是水西地区早已经变了一个模样，摆脱了落后的土司制度，百姓的积极性大增，各种工厂不断出现，已经成为了另一个更大的永定工业区。百姓的生活水平节节提高。
不止是贵州，四川西南已经改土归流地区同样在贵州的带动下，发展起来。
看到水西地区的变化，以及水西安家、石砫秦家从中得到巨大利益，贵州、四川还保留的土司纷纷向朝廷情愿，希望也能改土归流。就连云南靠近贵州地区的一些小土司也蠢蠢欲动。
也正是由于这个原因，朝廷才会放心让熊廷弼去贵州，取代董宣武。
但他们不知道，贵州百姓对董宣武颇为感激，不少人家，家里供着董宣武的生祠。董宣武在贵州势力已成，无论是民心还是军事、经济，都牢不可动。
由于黔军现在已经基本练成，董宣武也不是贵州总督，五行卫已经没有必要留在贵州，原驻扎于贵州的五行卫三营官兵移镇福建厦门，与驻扎台湾岛的两营官兵遥相呼应，保护大明东南沿海的安全。