第四次忍界大战的阴云终于散去了，木叶对外宣布了卑留呼之死的经过，又跟砂隐重申了盟约。想浑水摸鱼的岩隐只好作罢，也收兵退走。雾隐也松了口气，兵力撤回了村子，他们并不想在这时候打仗。只剩下了云隐，虽然雷影还在叫嚣着开战，但实际上谁都知道战争打不起来了。雷影虽然急躁，但并不是傻瓜，他也知道现在要跟木叶开战，只会给岩隐和雾隐创造机会。而且木叶和砂隐是同盟，雷影也没有把握能够同时战胜这两个大国。火之国的大名也为之前的言行，进行了道歉，并罢免了那个进谗言的大臣，以平息木叶的怒火。
虽然卑留呼做了错事，但人已经死了，尸体经过处理后，猿飞日斩亲自给这个学生举办了一个小型的葬礼，来参加葬礼的忍者，都是他昔日的伙伴，纲手、自来也都有出席。考虑到卑留呼的情况特殊，只能算半个木叶忍者，纲手就没有将其火葬，而是按照旧规矩，将他的棺木放入了木叶的隐墓群中。
佐井带回的另外4具尸体，悄悄交给了根部的忍者暗中处理研究。团藏对佐井这次的表现非常满意，这些血继限界者的情报可是太珍贵了。其他忍村也询问过木叶，各村的血继限界者的尸体情况，卡卡西等人都以为在金环日食战斗中完全摧毁了。事后，各个忍村也都到须弥山找过，没有发现，只好作罢。
对于木叶众忍者而言，这次的战斗，增强了实战能力和凝聚力，对各自忍术的提高都有很大的促进作用。晶臧也借此机会，得到了卑留呼留下的部分资料，对钢遁、迅遁、冥遁、岚遁都有了清晰的认识。卑留呼虽然号称第四忍，但能力远不如大蛇丸，但还是如此厉害，让众人心有余悸。大家彼此都看到了实力上的差距，更加卖力地修行起来。猿飞日斩对卑留呼的事情还颇为惋惜，“可惜了这个好苗子。当年如果我多关心他一些的话，就不会弄到这个地步。”
森林密处，一只黄鼠狼探头探脑，在四周游走，一棵大树下有个圆形的孔洞，黄鼠狼就钻了进去。这里就是大蛇丸的隐窟入口，大蛇丸的身体终于到了崩溃的边缘，“卑留呼也死了吗？他跟我一样，想要追求长生之术，可惜了，他的鬼芽罗之术，颇有些独到之处啊！时间也差不多了，只差一点点了。”兜道，“死亡森林中忍考试，到现在为止刚好3年了。”提起佐助的写轮眼和资质，大蛇丸很是自得，“好好培养的话，会成为比鼬更优秀的异才。对此，我坚信不疑。”
大蛇丸说了一堆追寻力量的大话，兜立即拍马屁，“因此你赐予他咒印，为了观察他的反应，而在考试中出手。”大蛇丸道，“你在说红豆吗？那个是偶然，反正我也想趁机吓唬一下木叶。”选拔赛时，大蛇丸故意让赤铜铠吸走佐助的查克拉，让佐助不得不借助咒印的力量。但是出乎大蛇丸的意料，佐助凭借意志抵抗住了咒印的侵袭，以体术狮子连弹击败了赤铜铠。大蛇丸大为惊喜，“人最为惊奇的地方，就在于他的意志。”佐助在面临绝境时，活用写轮眼的方法，让人叹为观止。
兜赞成这一点，“实战能让忍者大大成长。”大蛇丸接过兜递来的药物，“没有比我更适合培育他的人了。除了我，没有人能理解他心灵的黑暗。”兜不着痕迹道，“也是为了染上大蛇的痕迹吧！”大蛇丸吃下药物，兜道，“那次的木叶扫荡，简直是顺带的样子。”大蛇丸脸上出现厉色，“猿飞和团藏，这两个老不死的，都不是简单货色，那一次可是被他们摆了一道。这幅身体现在的这个糟糕状态，都是拜他们所赐。”
兜道，“差不多该准备转换身体的药了，这是为迎接转生仪式做最完全的准备。”大蛇丸在楼台之战时，被猿飞日斩封印了双手。撤退时，又被团藏的根部狠狠捅了一刀，损失惨重，多年创立的音隐村也不得不在这之后放弃。大蛇丸道，“这次不会再出差错了，计划进入了最终的阶段。之前那些泡汤的事情，也成为了微不足道的代价。终于，你的身体要成为我的东西了，佐助！这一切都是为了消除目标的黑暗！”
当年，大蛇丸和宇智波鼬先后加入晓组织，二人奉命组成搭档。大蛇丸却一直觊觎鼬的写轮眼，但他发动偷袭时，却被鼬轻而易举地击败了。
大蛇丸忽然咳嗽吐血，兜大惊失色。大蛇丸厉声道，“你在干什么啊，兜？”兜急忙询问状况，大蛇丸似乎还很兴奋，“没事的，再过一会儿，那副身体就是我的了。转生前刻，我的心情还是很好呢！”兜发现大蛇丸的身体已经到了极限，“如果不吃10级的药，身体恐怕会……”兜让大蛇丸先好好休息，他拿着托盘出去，准备换药。兜离开房间后，大蛇丸发出恐怖的阴森笑声。兜却很清楚，刚才大蛇丸的那个杀气，让身体完成超过了极限。兜自认为抱住了强大者的粗腿，“我才不会离开大蛇丸大人的身边呢！”
在兜看来，大蛇丸连续击败了四代风影和三代火影两大巨头，又差点摧毁了木叶，再重伤未愈的情况下，面对同是三忍的其中另外两位，也丝毫未落下风。兜得意洋洋，认为自己很有先见之明，选对了主人，“大蛇丸大人比那个时候更强大了，成长真是可怕啊！别说是五影，顺利的话，全大陆都会在大蛇丸大人面前屈服，在得到佐助身体的条件下。”
佐助依然在房间里进修，现在的他，已经完全能够做到鼬所传授的手里剑和苦无技术了。能够在凌空状态下，击中四面八方的所有死角的位置。佐助的千鸟洪流能够闪现更多的雷电，覆盖住周围的一切，这种强大的忍术，让人望而生畏。佐助摧毁鼬的模型后，向外走去。一只飞蛾扑向了火烛，顷刻间被烧成灰烬。佐助并不知道，他现在也许可以击败虚弱的大蛇丸，却绝不可能是宇智波鼬的对手。因为宇智波鼬已经掌握了三大神器的使用，初步进入了神影级的层次。
森林外面，黄鼠狼从圈形孔中突然跳出，捕获了一只仓鼠，带回了自己的巢穴，交给了它的一窝幼崽。一只大蛇追了过来，在洞穴口堵住了黄鼠狼一家子。大蛇钻入洞穴中追击黄鼠狼，却在捕食结束钻出地面时，被一只飞鹰抓走，反而成为猎物。
大蛇丸还在房间痛苦，这就是转生的代价，但这和得到东西比，这种痛苦就微不足道了。大蛇丸一边狂笑一边吐血，猛然他有些警觉，刺耳明亮的千鸟锐枪直接刺穿了房门，击向大蛇丸。大蛇丸大惊，伸手用手臂的封印挡住了千鸟锐枪的攻击，“这个查克拉性质是……但从未见过这种形态的变化。是谁？”房门在锐利的刀锋下粉碎，佐助扛着草薙剑，手执千鸟锐枪出现在门口。
大蛇丸道，“果然是你，这样干了。”佐助用千鸟锐枪牢牢压制住大蛇丸，“你已经压制不住我了，在你的面前，我也变得无情了。”佐助开启了写轮眼，发动了咒印的力量，准备一举击溃大蛇丸。如果是在平时，大蛇丸根本不惧佐助，但是现在的情况，对大蛇丸非常不利，佐助显然是蓄谋已久，早已洞悉一切，一直在等待这一天。同门之间，命悬一线的战斗，将会演绎无情的极致。
佐助压着千鸟锐枪向前走来，大蛇丸只好硬生生用手臂将千鸟锐枪的锋芒推移出去，代价是双臂被刺穿，喷血不止。佐助道，“大蛇丸，你比我还弱！我已经没必要把身体给你了。”大蛇丸道，“你还真敢说啊，宇智波家的雏子！”佐助冷笑，“没有我这个雏子，你无法得手吧！你给了我獠牙，希望用这个牵制住我。我是复仇者，能完成复仇目的的话，我认为扔了这幅身体也行。你也只是想要写轮眼吧！但是，你根本动不了鼬，你才找上我这个幸存的雏子。是这样的吧，被称为三忍之首的天才。但是你也只是世间的天才，别说超过，你根本无法触及宇智波的威名！”
“不管是什么样的天才，在宇智波面前，只能退为凡人。不断对自己下药，甚至夺取他人的身体，用恶心的方式接近宇智波的力量，你的所作所为，对拥有宇智波之名的我来说，简直是滑稽之极。而且我不喜欢你的做法。”佐助最反感的就是大蛇丸拿活人来做实验，“你的目的是什么？一边换基地，一边不停地实验，接二连三地草菅人命，说什么人间真理云云，冠冕堂皇的。不管解开这世间的道理是什么，因为无聊的利己理由，将他人玩弄于鼓掌之中。我都要吐出来了！”
佐助发动了强攻，千鸟锐枪光芒大盛，将大蛇丸的双臂钉在墙上。佐助也直冲过来，草薙剑刺中了大蛇丸的身体。大蛇丸张开了嘴巴，里面跑出来一条蛇，那条蛇落地后，瞬间变成了盘曲而卧的白磷大蛇，蛇头部赫然是大蛇丸的脑袋。佐助道，“白磷大蛇，这就是你的本体啊！从一个身体换到另一个身体，不断地实验，成就的就是这个德性吗？”大蛇丸喊道，“好了佐助，把身体给我吧！给我啊！”白磷大蛇扑向佐助，佐助跳起来躲避。白磷大蛇的身体是由一群群地小白蛇组成的，一些小蛇脱体而出，向佐助咬去。
佐助随手挥动草薙剑，将那些小蛇斩杀。佐助且战且走，向门外退去，一群群地白蛇紧追不舍，在草薙剑的刀光下，蛇尸铺了一地。佐助见这样下去没完没了，索性收回草薙剑，任凭那些白蛇缠住自己。佐助发动了咒印二，形态进行了改变，“钻地蛇想要飞天，终究是不可能的事情，还是死心吧！就算那样无论如何也还要做，盯上巢中雏子的你，反而被我盯上了，会误了卿卿性命！”白蛇群缠死了佐助，佐助的双翼打开，硬生生将白蛇群撑爆了，蛇尸血迹落了一地。
佐助道，“深陷飞往高空即将翱翔于天的鹰眼中，只是无谓的挣扎而已！”群蛇环绕，回旋进击佐助。佐助张开双翼，在通道中盘旋，右手闪现千鸟雷光剑。雷光剑从天而下，砍断了那群白蛇。大蛇丸怒吼着冲向了佐助。
佐助发动了千鸟洪流，雷鸣之声响彻了整个蛇窟，大蛇丸的本体白磷大蛇倒在血泊中，蛇身分出数段，败鳞残甲落了一地。佐助解除了咒印，变回了本体的样子，“结束了吗？也太不尽兴了！”佐助猛然发现身体不对劲，蹲在地上。大蛇丸的头突然开口说话，“看来差不多起效了。这大白蛇的体液是一遇到空气就会蒸发的麻痹毒药，看来你已经忘记了！我是不死之身，单凭你的术，还远远杀不了我！我就收下了，你的身体！”