直挂云帆济沧海，腊月二十四，在琉球休整了半个月的大明联合舰队再次启航，继续对倭国的巡检之旅。
本来董宣武计划在琉球渡过了除夕后再扬帆远征，琉球海战结束后，德川家光十多万兵马偷袭大明东南沿海的计划实际上已经破产。早一些攻打倭国，迟一些攻打倭国，其实并没有太大的区别。
不过琉球国已经决定了在来年的二月初举行全民公决，各方面的宣传、准备工作已经拉开。那么，大明联合舰队继续留在琉球，难免会授人以柄，难免有人会说琉球公决是在大明联合舰队武力威胁下举行的，大明以武力强行吞并了琉球国。
董宣武不愿给人以口实，所以缩短了在琉球的停留时间，各大舰船修葺完成后，立刻向琉球王辞行。
也是受琉球国全民公决的影响，董宣武也改变了对倭作战的战略目标。
原本的计划中，董宣武打算打残甚至彻底摧毁德川家族，让倭国再次陷入到诸侯争霸的分裂状态，无力觊觎华夏。
现在情况变了，琉球群岛对大明的战略地位实在是太重要了。如果对倭国的打击过大，让倭国再次陷入诸侯割据，内战不止的分裂状态，那么，琉球国所受的威胁和压力会小很多。琉球王尚丰很可能因为倭国威胁的消失，改变主意，不再请求归化大明。
这种为他人做嫁衣的事，董宣武当然不会干，所以，这次远征倭国的目标被改为削弱倭国的整体实力，震慑倭国，使之在一段时间内不敢再窥视华夏，并不打算摧毁倭国现有的江户幕府，依然让其具统治倭国的能力。
这个时代的倭国，主要由本州、四国、九州三座大岛组成，虽然十六世纪末，松前氏渡海在虾夷（北海道）建造了福山城，占领了一部分虾夷的土地，但直到天启年间，并没有建立起对虾夷的绝对统治。
公元前300-公元250年，随着渡来人（即来自华夏、朝鲜等地大陆移民)的移入，倭国有了初始的文明。出现了陶器、铁、铜器以及水田等文化，逐渐进入农业社会。
大约是在弥生时代中期，位于九州的倭国国王向汉朝朝贡，受册封获赐金印，倭国之名由此得名。
2世纪后半期，岛内各小国之间战事频繁。3世纪中叶其中一个较大的国家——大和国崛起，经过长期的扩张，逐渐征服了倭国中部大部分地方。其首领最初称为“大王”，后来仿唐高宗，改称天皇。倭国才有了所谓的天皇。
佛教也是在这一时期通过百济传到了倭国，并蓬勃发展起来，在我国的经济、政治、军事上都占据有十分重要的地位。
在经历了古坟时代、飞鸟时代，奈良时代、平安时代后。天皇的权力逐渐旁落，随着镰仓幕府成立，天皇完全被架空，倭国进入幕府执政的时期。
幕府执政又大致分为镰仓时代、南北朝时代、室町时代、安土桃山时代和如今的江户时代。
镰仓时代始于1185年（文治元年）镰仓幕府成立，终于1333年（正庆二年、元弘三年）幕府灭亡，历经149年。
在北条时宗在位的时候，元世祖忽必烈曾两次侵日未果。北条时宗后期，镰仓幕府的统治日渐衰败。
后醍醐天皇趁机举兵，联合讨伐大将、上野大族足利尊氏铲除了镰仓幕府。
灭掉了镰仓幕府后，后醍醐天皇试图恢复王政复古，推行新政，史称建武新政。
此举遭到了手握重兵的足利尊氏反对，足利尊氏逼迫后醍醐天皇退位，并拥立了光明天皇为新天皇，新天皇策封他为征夷大将军，是为北朝。
失败的后醍醐天皇退位后持着象征天皇权力的三神器退逃到大和的吉野（今奈良县），聚集反对势力与北朝相抗衡，是为南朝。
倭国的南北朝由此而形成。
足利氏原是上野的豪族，也是镰仓幕府将军源赖朝的同族，足利尊氏在京都的室町开设幕府，开创了室町幕府。
室町幕府第三代将军足利义满（注1）统一了南北朝。
在第八代将军足利义政在位的时候，因继承权问题爆发了应仁之乱，自此室町幕府的权威日下。
原本受幕府册封于各地的守护大名，有的渐渐被守护代（副官）、家臣、国人篡夺政权，有的可以保持政权至战国时代。
从应仁之乱开始，至足利幕府灭亡，称为战国时代。
天正元年（公元1573年），织田信长放逐了末代将军足利义昭，足利幕府宣告灭亡。
织田信长逐渐成为倭国最为强大的军阀，并积极拓展统治版图。
天正十年（公元1582年），织田消灭甲斐大名武田氏，几乎完全控制京都近畿与东海地方，并将势力延伸至中国地方、甲信越地方、四国地方以及北陆地方。倭国实际统治中心也转移到安土城的织田氏手上。
同年，织田信长部将明智光秀发动本能寺之变，织田信长死去。
明智光秀打败织田信长长子、织田家家督织田信忠败给后自杀，整个织田氏顿时陷入混乱。
公元1584年，羽柴秀吉与德川家康爆发会战，双方对峙许久没有分出胜负，和解并结为同盟。
同年，大坂城完工，羽柴秀吉以此为根据地，开始了统一倭国的计划。
经过四次的大规模讨伐后，公元1590年，羽柴秀吉终于大致上完成全国的统一，天皇赐姓丰臣。
公元1598年，丰臣秀吉去世，倭国再度陷入混乱。
庆长五年（公元1600年），关原合战德川家康战胜，奠定了江户幕府的天下。
庆长八年（1603年），德川家康被天皇任命为征夷大将军，在江户设幕府。
庆长十年（1605年），德川家康为了确立将军世袭制，将征夷大将军之位让于第三子德川秀忠，此举引起了倭国朝廷和丰臣氏的强烈反对。在挫败了丰臣氏和朝廷的反对之后，德川秀忠接替德川家康成为征夷大将军。德川家康自称“大御所”，迁居到骏府城遥控幕府。