具体来说有两个高峰，以及随后而来的两个崩坏点。因为作者岸本太注重主角光环，让剧情从那以后一步一步地崩坏。
先讲两个高峰前的一个小高峰是宇智波佐助与迪达拉的战斗。这场战斗延续了忍者世界斗智斗勇的战斗，不讲究大画面和壮观的景象，但比拼实打实的战斗，查克拉的运用，属性相克，各种套路反套路，基本把火影忍者中战斗元素的优点都展现了出来，战斗的结果是佐助依靠智力碾压+蛇爹场外援助费了九牛二虎之力打败了迪达拉。
在这之后，作者岸本齐史延续了精彩，并奉献了火影忍者世界最为跌宕起伏的两场战斗，分别是自来也单挑佩恩六道，以及佐助决战宇智波鼬。前者，战斗本身的意义价值，战斗的过程，以自来也和蛤蟆爹娘为第一视角的对手分析，最终的套路、反套路，不认输以及自来也的从容赴死，给读者展现了自来也最强大的一面，不论是忍术、查克拉、智力还是精神力。自来也的死亡和佩恩的现身也标志着火影忍者创作的绝对顶峰。
而紧接下来的另一场战斗，佐助和宇智波鼬的决战，明线是二人的战斗，包括忍术和幻术的运用，你的大招完了是我的大招，我的大招完了你还有个大招。暗线是宇智波族灭谜团逐步地露出身影，而佐助进一步黑化，慢慢向晓组织靠拢。这一场战斗因为涉及到主角的心路历程过于极端的变化，以及高端的幻术对决，可以说是疾风传后期最精彩的宇智波鼬幻术系列。
而在这两大高峰之后，出现了两大败笔。伴随这两大败笔，小鬼传和疾风传严谨的能力设定开始崩坏，上古巨兽开始涌现，并最终以第四次忍界大战这种把吃过的饭菜再炒一次的方式，结束了这个不伦不类的漫画。
第一大败笔就是鸣人与佩恩的战斗，一个三年修炼没大长进的鸣人，在妙木山临阵磨枪就成了可以单挑佩恩的木业英雄。一个前两天还体术幻术忍术样样精通360度无死角的MMORPG在鸣人面前就成了站着挨打只会数cd按技能的小学生，你说读者能作何感想？再加上一个口遁术，直接让剧情720度漩涡崩塌。
第二大败笔是佐助捣乱五影大会以及单杀志村团藏。实际上整场战斗的打斗情节都还算比较精彩，但让人无语的是能力设定的崩坏。宇智波鼬当年放天照和须佐能乎累了个半死吐血n升，到佐助这里全程无限魔法无限cd靠着一个奶妈的补给就搞得五影大会开不下去，卸了雷影的一条胳膊，五影颜面何在？志村团藏再怎么说也是和三代争火星的人物，在佐助面前成了堵着水泉秒火星如人机，甚至转身手里剑就能解决一条命，你敢信？团藏真要这么菜，当年咋和三代争的？
从这之后，岸本也开始彻底放飞自我了。当然，还是能稍微收住一下，有了四代与宇智波带土的超时空对决，但后面的忍界大战，三代雷影当年1v10万被鸣人(还是个分身)直接打爆。佐助换了眼睛放天照和须佐能乎真的无限cd无限蓝了。达鲁伊靠着念口头禅搞定金角银角(我叫你一声逗比你敢答应么？)。卡卡西一只二手眼睛要不是带土就真的给秒了外道魔像(我擦你宇智波家族的眼睛这么牛叉的么？)。宇智波斑可以复活，带土可以由死写活，四大上古巨兽靠着解尸鬼封尽和秽土转生成功复活，各种大型忍术满天飞。就是这样，十尾都能被山中井野的小技能控制两秒，老大你玩过dota么知道2秒啥概念么？
再之后，斑变身白的，老妈和隐藏的大哥出场，其实到这个时候战斗剧情有了一些回归，很多打斗也都从无脑AOE随便甩变成了一些经典的套路和操作，比如辉夜姬控制地心引力与飞剑，一个简单但是特别厉害的套路就让所有人无可奈何。但可惜剧情接近尾声于事无补。一个本身故事情节很优良的漫画作品，就这样随着能力值的崩坏，剧情的崩塌，以及网游情节的堆积，彻底毁掉。追本溯源，一切从鸣人和佐二少犯二就已经开始了。
从舍弃忍术需要结印这个设定开始，本来火影是一部不以唯查克拉论的，拼综合实力的优秀作品，但我估计是岸本实在是编不下去了，所以你会发现到后期基本所有忍术的结印都没有了，即使有也只有一个动作。
这就是为什么鸣人最开始学会螺旋丸会造成这么大的轰动，因为当时在所有术都要结印的年代四代的专属螺旋丸就是这么NB的忍术(瞬发，没有施法前摇，玩过moba类游戏你应该能理解一个英雄技能瞬发优势有多大)，也因为结印的设定才能把非查克拉以外的条件引入对战(分析，偷袭，利用信息不对称，通过结印模仿对方的忍术)结果后面慢慢的这个都没有了，火影硬生生从一个斗智斗勇的群像剧变成了单一主角龙傲天。
这也是为什么会出现人物塑造方面的断层，前期人物到后期一点屁用都没有，因为评价体系单一化了，以前并不是靠查克拉量为主要战斗方式的优秀主演员们在后面真的是显得一点屁用没有，同时也导致这些背负了“影”之名的各国最强者们表现出来的实力都如此弱鸡。
其实岸本最后第四次忍界大战尝试过找回那种分析流，执行战术的战斗模板(例如二代和三代在对战六道带土时分析求道玉的属性定义为四种属性上的超级血继限界以及破解方法)，但估计发现好像圆不回来了于是强行加设定五行遁对阴阳遁无效(哈哈哈，手动滑稽)，这样就出现了一个大问题，大哥你这样搞，把这些用了一辈子忍术的人置于何地，哦你一句话都把前面用了600多集构筑的忍术体系推翻，那还打个毛啊，然后发现主角团也都是五行遁，全世界都是五行遁，得了接着圆呗。于是又加忍术查克拉无效，仙术查克拉有效(哈哈哈哈)，这搞得大家就很尴尬，这也是为什么后期战斗完全看不懂，各种设定崩坏，人设崩塌，强行五五开(头晕，恶心)
所以变水不是哪一卷开始的，是慢慢的把评价体系和战斗体系单一化开始的！
从佩恩进攻木业开始，在这之前火影忍者是用鸣人的视角讲述整个忍者世界。在这一篇章之后就变成真正的鸣人传了。佩恩之前，鸣人虽为主角，但在每个篇章里出场时间占比都不是很大，而且往往不是最出彩的人物或事件。波之国篇是卡卡西的主场，鸣人二柱子白也是齐头并进。中忍考试篇前半段鸣人更是彻底的紧紧担当一个视角角色，正式出场剧情了了可数，他与牙的比赛更是能竞选中忍考试篇最无聊的比赛之一，我爱罗、李洛克等人光芒四射，卡卡西佐助的寥寥镜头才是真正的主线。考试篇后半段鸣人出场多了，但在山雨欲来风满楼的整体大环境下，鸣人视角有点类似以管窥豹不得见其真身的，其实本质仍然是一个大蛇丸进攻木业事件的前主视角，鸣人只负责修炼，主线剧情推进却由自来也卡卡西二柱子的插放镜头负责，只是这个篇章中鸣人和宁次的战斗挺精彩而已（但也未必超过鹿丸和手鞠一战），最终剧情推进却是由佐助我爱罗一战负责，刨去鸣人修炼和宁次比赛的剧情，完全不影响这个篇章主线的进展。暨虽然鸣人在这一篇章出场占到百分之80，其实仍旧只是一个视角见证者而已。大蛇丸篇，同样如此，鸣人一直游离于主线剧情之外，木业境内由三代目和只有几个镜头的上忍负责，追击我爱罗则是二柱子和油女志乃在前，鸣人直到最后的大决战才出场，而且这个大决战无论对剧情走向影响还是对观众观感而言都要远低于三代目和大蛇丸的决战（毕竟火影对战代表了当时剧情下的最高战力的战斗方式）鼬登场篇鸣人甚至都不在村内，他只是这个篇章的名义起头（鼬要抓鸣人），但暗地主角是宇智波家族，鸣人同样只负责修炼，主剧情属于鼬。三忍篇，鸣人虽然算是第一次融入主线剧情，但受限于武力值，他只是负责情感方面的主线，其余的全部要由三忍推动，而且要注意这里纲手的情感转变与火影剧情崩溃之后人物情感转变的巨大不同，纲手作为年长的成年人，她的情感转变全都是出于自身，鸣人最多是催化剂的作用，他根本无法用嘴遁影响纲手。追击佐助篇，主线不复杂，但人物众多，鸣人和二柱子两主角基本隐身，丁次，手鞠，我爱罗等人获得了充足的登场时间，俩主角在其他配角表演完毕后才大决战画上句号。我认为火影第一部整体上是超过第二部很多很多的，通过总结可以看到除了最后追击佐助，鸣人似乎总是游离于主线之外，但正是由于这种游离，使作者可以更游刃有余的从主线的多个角度，多个人物去推动剧情展现剧情。而且主角不再剧情里，使得大boss不再属于主角专有，这样对于战斗热血漫来说，观众不再具备上帝视角，无从掌握事件的全貌，战斗的胜负，毕竟一个没有主角的战斗，谁胜谁败都有可能。而且主角不参与或不围绕主角开展剧情，配角就有更多的表现机会，人物会更丰满，剧情走向也有更多可能。。而从佩恩入侵之后，不但视角锁定鸣人，剧情也全由鸣人推进，战斗的胜负早已剧情杀，毕竟主角又不能死。走向上更是被锁死，反正主角团一定最终胜利。。最主要的是配角没有了发挥和展现的篇幅，和之前的剧情对比，佩恩之战后再也没有哪个配角去担当一个小篇章的主角了，配角被锁死为主角团的和boss团，因为剧情走向单一，佩恩大战后火影世界已经没有独立于这两大团体之外的中立团队了，这又反过来束缚了剧情的走向，形成恶性循环，变成单纯的打怪升级漫画。。
要我说《火影忍者》质量下降从迪达拉袭击我爱罗就开始了~
我爱罗好说歹说也是信任风影，守贺人柱力，砂忍村最高战力之一，但是面对对方一个对手单挑的情况下居然被抓，而且在场的其余砂忍上忍就只能这么干看着，迪达拉真的是做到了“百万军中取上将首级如探囊取物”！
虽然这么说略显夸张了一点，但是我爱罗在占尽主场优势的情况下，面对一个对手居然拿不下来反被对方生擒，一个长门足以横扫木叶，一个迪达拉能生擒我爱罗，如果再多来几个“晓”一个个对七大忍村攻城拔寨绝不是难事.....
而到了决战，转生出来的所有影级高手几乎全是主角拿下的，所谓最佳脑力的奈良一族也没有起到扭转战局的任何作用，八万训练有素、中远近忍术配合的联军居然和十万白绝拼到了一个换一个的地步.....
至于BUG级的轮回眼，万花筒血轮眼更是牛掰到不忍直视！鸣人有九喇嘛开开高达也就算了，佐助居然靠升级双目也开上了高达，主角除了BUG级的体质之外，还加上了远祖转世的设定，原本说好的励志热血动漫呢？战斗溢出惨不忍睹，骇人听闻！
想想第一部大蛇丸、一二代火影、三代火影、猿猴王五大高手齐聚木叶某建筑的屋顶，战斗力也不过就是在几百平米的屋顶上折腾一番，而到了后半截出手不是炸村就是砍山，被誉为忍者之神的三代火影不得不在血迹限界面前默默垂泪.....
而实际上初期设定查克拉本身应该没有属性，应该是查克拉+手印=术的模式，初代的木遁最早被称之为秘术，而不是“血迹限界”，真正的血迹初期只有白，佐助和日向家这几个极少数个例，所以写轮眼才要通过拷贝记忆手印的方式，复制对方忍术的能力，三代火影才通过掌握手印的数量获得了最强火影的称号！
初期的写轮眼是动态视力、瞬间记忆和催眠；白眼的能力是远距离视力和透视人体骨骼筋脉，但是后面我们都知道了不但查克拉本身有了属性，而且血迹限界满大街都是，血轮眼更是堪称BUG级的存在，主角和周围人的差距已经可以说是云泥之别，他人再也望尘莫及！
最后主角带领团结一心的忍者联军大败邪恶反派的一幕没有出现，鸣人几乎凭借一己之力救了整个世界，漫威都不敢这么写....
我们再来看看武侠小说前辈金庸古龙是怎么写的，《射雕英雄传》疯疯癫癫的欧阳锋成了中原第一，杨过虽然火烧蒙古大营但也是最后众人同守襄阳才旗开得胜；楚留香本人也多有侥幸才敌过水母阴姬、薛衣人等绝顶高手....
相比鸣人等主角的挂开的太严重，也太不合情理了，让人觉得索然无味~
长门被鸣人嘴遁，用轮回天生复活所有人的那一刻。
其实本来嘴遁也无所谓，只要你说的有模有样，符合热血漫画的设定，嘴遁死几个人真心无所谓。但是吧，你把所有人全复活是个什么鬼？生死界线可谓是人生中最重要的一道坎了。例如《海贼王》中莫利亚篇，布鲁克一个人孤独几十年，每次做梦梦到和伙伴在一起，醒来时发现自己骷髅之姿孤身一人，可谓是非常打动人。生死之间的感情绝对是最催泪的感情了。
一旦这个界限被打破了，那就完蛋了。从那刻起，火影忍者在我看来已经变成了搞笑漫画了。死了人？没关系，秽土转生（轮回天生等其他复活术）就好了。我旗木五五开死了，没关系，在阴间和老爸聊聊天，拍拍屁股就回去了。所有生死之间的决断、自我牺牲，在此之后都显得毫无泪点可言。
最近重温火影忍者第一部漫画，发现真的很有意思：各个小强各有各的能力，风头正劲丝毫不让（二柱子开写轮眼被小李吊打，小李说宁次是最强下忍）；忍者只是会使用忍术的人，不能用忍术的话和普通人无异（再不斩双手被废，被一群混混武士砍死）；团队配合、伙伴的感情显得弥足珍贵（中忍考试笔试第十题，小樱为了鸣人的梦想准备自己举手放弃以后当中忍的资格）；大蛇丸还能装逼，吓尿一群上忍。
火影忍者后期就不说了，神仙打架，身上没个六道血统或者眼珠子就没法打架了。大家都沦为背景板，看个乐就好。不过岸本还是挺有节操的，再怎么崩坏好歹都给圆上了。看看隔壁死神，真
腰斩